Olá Julio!
Para medir com precisão o tamanho de um objeto em uma imagem eu sugiro você utilizar um algoritmo específico para isso. Existem várias heurísticas hoje bem definidas feitas para chegar a esse resultado, mas talvez uma das mais confiáveis usam esse artigo como referência. Além disso, o autor também fornece já o código completo para fazer isso no próprio OpenCV.
Esse processo exige atenção para alguns detalhes, então recomendo ver com calma o artigo pois lá explica bem certo. É importante seguir as recomendações para deixar o algoritmo bem calibrado, como por exemplo ajustar bem o objeto de referência para medir do modo mais preciso possível (isso é explicado detalhadamente no artigo).