Kleber, infelizmente o Anaconda às vezes tem esses problemas misteriosos sem solução fácil, eu mesmo já tive que desinstalar e reinstalar o pacote inteiro mais de uma vez. O que você pode tentar é criar um ambiente novo com o pacote anaconda e tentar rodar o Spyder a partir do Anaconda Prompt:
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conda create -n new anaconda spyder (geralmente instalando “anaconda” o Spyder vem junto, mas por garantia pode explicitar “spyder” também).
conda activate anaconda
spyder
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