Tudo bom Professor? Legal te reencontrar depois de todos esses anos.
Este problema, você provavelmente consegue resolver fazendo downgrade do scipy, eu acredito que a versão 0.15.1 deve ser suficiente.
Mas como comentei na sua outra dúvida, o PyBrain não recebe mais atualização desde 2015, então eu recomendo utilizar o Scikit-Learn (que também é coberto neste curso, mas implementa redes “fechadas”, com pouco controle fino), ou o Keras (que é mais parecido com PyBrain mas hoje é uma das bibliotecas mais utilizadas para Deep Learning). Aqui na plataforma tem outros cursos focados mais em Keras/TensorFlow.
Um abraço!